Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms