Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms