Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms