Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl11Q9CXW4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms