Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Exo5Q9CXP9 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Exo5Q9CXP9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Exo5Q9CXP9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Exo5Q9CXP9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms