Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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