Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmed5Q9CXE7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.2 ms