Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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