Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9CRC3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9CRC3 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms