Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Nicn1Q9CQM0 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Nicn1Q9CQM0 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Nicn1Q9CQM0 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Nicn1Q9CQM0 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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Nicn1Q9CQM0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nicn1Q9CQM0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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