Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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