Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rpa3Q9CQ71 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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