Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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