Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sf3b1Q99NB9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sf3b1Q99NB9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sf3b1Q99NB9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sf3b1Q99NB9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sf3b1Q99NB9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sf3b1Q99NB9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sf3b1Q99NB9 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sf3b1Q99NB9 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms