Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms