Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ddb2Q99J79 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Ddb2Q99J79 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Ddb2Q99J79 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Ddb2Q99J79 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Ddb2Q99J79 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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