Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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