Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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