Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufs8Q8K3J1 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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