Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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