Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Lrit1Q8K099 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Lrit1Q8K099 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Lrit1Q8K099 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Lrit1Q8K099 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Lrit1Q8K099 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Lrit1Q8K099 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Lrit1Q8K099 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Lrit1Q8K099 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Lrit1Q8K099 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Lrit1Q8K099 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Lrit1Q8K099 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Lrit1Q8K099 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Lrit1Q8K099 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Lrit1Q8K099 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Lrit1Q8K099 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Lrit1Q8K099 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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