Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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