Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Hpf1Q8CFE2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms