Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

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Length 866 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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