Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms