Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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