Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms