Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms