Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ccdc113Q8C5T8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ccdc113Q8C5T8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ccdc113Q8C5T8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ccdc113Q8C5T8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ccdc113Q8C5T8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ccdc113Q8C5T8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ccdc113Q8C5T8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ccdc113Q8C5T8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ccdc113Q8C5T8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ccdc113Q8C5T8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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