Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms