Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trerf1Q8BXJ2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trerf1Q8BXJ2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trerf1Q8BXJ2 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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