Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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