Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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