Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms