Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Liat1Q810M6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Liat1Q810M6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Liat1Q810M6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms