Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrfn4Q80XU8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrfn4Q80XU8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrfn4Q80XU8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrfn4Q80XU8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrfn4Q80XU8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrfn4Q80XU8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrfn4Q80XU8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Lrfn4Q80XU8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrfn4Q80XU8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrfn4Q80XU8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrfn4Q80XU8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrfn4Q80XU8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrfn4Q80XU8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrfn4Q80XU8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrfn4Q80XU8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrfn4Q80XU8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrfn4Q80XU8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrfn4Q80XU8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrfn4Q80XU8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
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Lrfn4Q80XU8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrfn4Q80XU8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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