Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
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Pcsk9Q80W65 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Pcsk9Q80W65 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Pcsk9Q80W65 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Pcsk9Q80W65 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Pcsk9Q80W65 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Pcsk9Q80W65 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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