Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SnupnQ80W37 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms