Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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