Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Vma21Q78T54 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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