Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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