Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Ccdc88cQ6VGS5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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