Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Snx13Q6PHS6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Snx13Q6PHS6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Snx13Q6PHS6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Snx13Q6PHS6 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Snx13Q6PHS6 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Snx13Q6PHS6 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Snx13Q6PHS6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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