Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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