Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trim37Q6PCX9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trim37Q6PCX9 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trim37Q6PCX9 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trim37Q6PCX9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trim37Q6PCX9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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