Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp49Q6P9L4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp49Q6P9L4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp49Q6P9L4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp49Q6P9L4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp49Q6P9L4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp49Q6P9L4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp49Q6P9L4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp49Q6P9L4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp49Q6P9L4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp49Q6P9L4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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