Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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