Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Krt77Q6IFZ6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Krt77Q6IFZ6 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Krt77Q6IFZ6 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Krt77Q6IFZ6 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Krt77Q6IFZ6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Krt77Q6IFZ6 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Krt77Q6IFZ6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Krt77Q6IFZ6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Krt77Q6IFZ6 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Krt77Q6IFZ6 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Krt77Q6IFZ6 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Krt77Q6IFZ6 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Krt77Q6IFZ6 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Krt77Q6IFZ6 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Krt77Q6IFZ6 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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