Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pdzrn3Q69ZS0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pdzrn3Q69ZS0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Pdzrn3Q69ZS0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Pdzrn3Q69ZS0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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