Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms